Множественное выравнивание совокупности аминокислотных последовательностей на основе вероятностной модели эволюции

Журнал: 
Страница: 
202
УДК: 
681.327.12
 Задача измерения группового сходства аминокислотных последовательностей белков является одной из фундаментальных проблем молекулярной биологии. Существующие алгоритмы решения данной задачи (алгоритмы множественного выравнивания) не основаны на какой-либо формальной постановке задачи и не базируются на единой модели эволюции белков. В данной работе предлагается принципиально новый подход к измерению группового сходства, в основе которого лежит вероятностная эволюционная модель преобразования аминокислотных последовательностей.
info_eng: 
The problem of measuring group similarity of amino acid sequences is one of fundamental issues of the modern bioinformatics. Existing algorithms for decision this problem (so called multiple alignment procedures) are not based on any formal problem definition and any model of evolution of proteins. In this paper we propose a new approach for measuring group similarity of proteins, which is founded on probabilistic evolutionary model of transformation of amino acid sequences.